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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_33952
Cell Name :  JR12-vSUB-6
Archive Name :  Radley
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  275 grams
Max Weight :  300 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  subiculum
Secondary Brain Region :  stratum pyramidale
Tertiary Brain Region :  ventral
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Chronic variable stress (CVS)
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2014-01-02
Date of Upload :  2015-10-06
Persistence Vector :  JR12-vSUB-6.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Chronic stress-induced alterations of dendritic spine subtypes predict functional decrements in an hypothalamo-pituitary-adrenal-inhibitory prefrontal circuit.

Measurements
Soma Surface :  906.22 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  24
Number of Branches :  53
Overall Width :  252.55 μm
Overall Height :  438.06 μm
Overall Depth :  137.55 μm
Average Diameter :  0.52 μm
Total Length :  4027.25 μm
Total Surface :  7024.93 μm2
Total Volume :  4609.67 μm3
Max Euclidean Distance :  261.32 μm
Max Path Distance :  354.25 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.81
Total Fragmentation :  1524
Partition Asymmetry :  0.45
Average Rall's Ratio :  1.91
Average Bifurcation Angle Local :  84.76°
Average Bifurcation Angle Remote :  65.38°
Fractal Dimension :  1.04

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