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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_33882
Cell Name :  JR12-PL-13
Archive Name :  Radley
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  275 grams
Max Weight :  300 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Chronic variable stress (CVS)
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2014-01-02
Date of Upload :  2015-10-06
Persistence Vector :  JR12-PL-13.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Chronic stress-induced alterations of dendritic spine subtypes predict functional decrements in an hypothalamo-pituitary-adrenal-inhibitory prefrontal circuit.

Measurements
Soma Surface :  585.03 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  13
Number of Branches :  30
Overall Width :  178.06 μm
Overall Height :  266.6 μm
Overall Depth :  119.06 μm
Average Diameter :  1.59 μm
Total Length :  1589.13 μm
Total Surface :  8264.86 μm2
Total Volume :  5061.08 μm3
Max Euclidean Distance :  237.78 μm
Max Path Distance :  321.31 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.8
Total Fragmentation :  602
Partition Asymmetry :  0.63
Average Rall's Ratio :  2.05
Average Bifurcation Angle Local :  83.5°
Average Bifurcation Angle Remote :  61.24°
Fractal Dimension :  1.05

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