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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_02557
Cell Name :  JMn091304-10-1
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  18.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  layer 4
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  custom
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2008-02-06
Date of Upload :  2008-07-15
Persistence Vector :  JMn091304-10-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Internal dynamics determine the cortical response to thalamic stimulation

Measurements
Soma Surface :  728.34 μm2
Number of Stems :  10
Number of Bifurcations :  23
Number of Branches :  56
Overall Width :  145.32 μm
Overall Height :  592.19 μm
Overall Depth :  46.5 μm
Average Diameter :  0.29 μm
Total Length :  3029 μm
Total Surface :  3109.57 μm2
Total Volume :  340.33 μm3
Max Euclidean Distance :  517.38 μm
Max Path Distance :  621.41 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.83
Total Fragmentation :  1326
Partition Asymmetry :  0.49
Average Rall's Ratio :  1.3
Average Bifurcation Angle Local :  66.57°
Average Bifurcation Angle Remote :  56.52°
Fractal Dimension :  1.06

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