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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_02551
Cell Name :  JMn030105-20-2
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  18.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  layer 4
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  custom
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2008-02-06
Date of Upload :  2008-07-15
Persistence Vector :  JMn030105-20-2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Internal dynamics determine the cortical response to thalamic stimulation

Measurements
Soma Surface :  683.9 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  52
Number of Branches :  109
Overall Width :  222.95 μm
Overall Height :  409.7 μm
Overall Depth :  57.5 μm
Average Diameter :  0.29 μm
Total Length :  6061.32 μm
Total Surface :  6047.44 μm2
Total Volume :  685.63 μm3
Max Euclidean Distance :  305.51 μm
Max Path Distance :  447.9 μm
Max Branch Order :  12
Average Contraction :  0.78
Total Fragmentation :  3134
Partition Asymmetry :  0.45
Average Rall's Ratio :  1.33
Average Bifurcation Angle Local :  73.21°
Average Bifurcation Angle Remote :  62.71°
Fractal Dimension :  1.09

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