8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_02550
Cell Name :  JMn030105-20-1
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  18.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  layer 4
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  custom
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2008-02-06
Date of Upload :  2008-07-15
Persistence Vector :  JMn030105-20-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Internal dynamics determine the cortical response to thalamic stimulation

Measurements
Soma Surface :  683.9 μm2
Number of Stems :  10
Number of Bifurcations :  57
Number of Branches :  124
Overall Width :  303.15 μm
Overall Height :  814.03 μm
Overall Depth :  67 μm
Average Diameter :  0.3 μm
Total Length :  6624.7 μm
Total Surface :  6827.04 μm2
Total Volume :  727.77 μm3
Max Euclidean Distance :  688.07 μm
Max Path Distance :  890.03 μm
Max Branch Order :  11
Average Contraction :  0.76
Total Fragmentation :  3446
Partition Asymmetry :  0.46
Average Rall's Ratio :  1.52
Average Bifurcation Angle Local :  65.71°
Average Bifurcation Angle Remote :  58.27°
Fractal Dimension :  1.12

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website