8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_02542
Cell Name :  JMcell7or1-1
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  18.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  layer 4
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  custom
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2008-02-06
Date of Upload :  2008-07-15
Persistence Vector :  JMcell7or1-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Internal dynamics determine the cortical response to thalamic stimulation

Measurements
Soma Surface :  1216.34 μm2
Number of Stems :  9
Number of Bifurcations :  91
Number of Branches :  191
Overall Width :  338.46 μm
Overall Height :  629.79 μm
Overall Depth :  62.5 μm
Average Diameter :  0.38 μm
Total Length :  7962.75 μm
Total Surface :  10146.79 μm2
Total Volume :  1808.35 μm3
Max Euclidean Distance :  513.39 μm
Max Path Distance :  776.21 μm
Max Branch Order :  13
Average Contraction :  0.74
Total Fragmentation :  3816
Partition Asymmetry :  0.48
Average Rall's Ratio :  1.52
Average Bifurcation Angle Local :  69.34°
Average Bifurcation Angle Remote :  56.85°
Fractal Dimension :  1.1

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