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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_02497
Cell Name :  JM080603-40
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  18.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  layer 4
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  custom
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2008-02-06
Date of Upload :  2008-07-15
Persistence Vector :  JM080603-40.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Internal dynamics determine the cortical response to thalamic stimulation

Measurements
Soma Surface :  571.42 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  30
Number of Branches :  67
Overall Width :  226.32 μm
Overall Height :  557.56 μm
Overall Depth :  33.5 μm
Average Diameter :  0.49 μm
Total Length :  3556.41 μm
Total Surface :  5660.37 μm2
Total Volume :  767.19 μm3
Max Euclidean Distance :  607.51 μm
Max Path Distance :  650.08 μm
Max Branch Order :  12
Average Contraction :  0.83
Total Fragmentation :  1002
Partition Asymmetry :  0.57
Average Rall's Ratio :  1.47
Average Bifurcation Angle Local :  75.63°
Average Bifurcation Angle Remote :  55.74°
Fractal Dimension :  1.07

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