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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_02480
Cell Name :  JM020404-30-1
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  18.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  layer 4
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  custom
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2008-02-06
Date of Upload :  2008-07-15
Persistence Vector :  JM020404-30-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Internal dynamics determine the cortical response to thalamic stimulation

Measurements
Soma Surface :  610.9 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  44
Number of Branches :  94
Overall Width :  232.44 μm
Overall Height :  594.27 μm
Overall Depth :  43.07 μm
Average Diameter :  0.34 μm
Total Length :  4295.64 μm
Total Surface :  4929.57 μm2
Total Volume :  634.59 μm3
Max Euclidean Distance :  509.7 μm
Max Path Distance :  604.36 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.77
Total Fragmentation :  1793
Partition Asymmetry :  0.45
Average Rall's Ratio :  1.41
Average Bifurcation Angle Local :  72.51°
Average Bifurcation Angle Remote :  56.16°
Fractal Dimension :  1.1

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