8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_02476
Cell Name :  JM012804-40-2
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  18.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  layer 4
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  custom
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2008-02-06
Date of Upload :  2008-07-15
Persistence Vector :  JM012804-40-2.pvec
Note :  Apical dendrite cut
 

Reference Article
Related Article Reference :  Internal dynamics determine the cortical response to thalamic stimulation

Measurements
Soma Surface :  621.41 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  46
Number of Branches :  99
Overall Width :  179.05 μm
Overall Height :  457.02 μm
Overall Depth :  9.99 μm
Average Diameter :  0.26 μm
Total Length :  4445.66 μm
Total Surface :  3845.89 μm2
Total Volume :  307.41 μm3
Max Euclidean Distance :  343.75 μm
Max Path Distance :  628.38 μm
Max Branch Order :  11
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  1483
Partition Asymmetry :  0.44
Average Rall's Ratio :  1.67
Average Bifurcation Angle Local :  57.92°
Average Bifurcation Angle Remote :  64.55°
Fractal Dimension :  1.1

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