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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_102251
Cell Name :  JG250214S1C1
Archive Name :  Staiger
Species Name :  mouse
Strain :  B6.Cg-Tg(Scnn1a-Cre)3Aibs/J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  42.0 days
Max Age :  42.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  30 grams
Max Weight :  30 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  barrel, layer 4, lower corner of the barrel, primary somatosensory
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  stellate
Tertiary Cell Class :  Spiny
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Streptavidin Alexa 633
Slicing Direction :  thalamocortical
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-05-29
Date of Upload :  2018-11-27
Persistence Vector :  JG250214S1C1.pvec
Note :  In the original morphology file, the reconstruction is upside down: the pia is at the bottom and the white matter at the top.

Reference Article
Related Article Reference :  Thalamocortical Connections Drive Intracortical Activation of Functional Columns in the Mislaminated Reeler Somatosensory Cortex.

Measurements
Soma Surface :  385.68 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  81
Number of Branches :  169
Overall Width :  481.87 μm
Overall Height :  974.13 μm
Overall Depth :  62.91 μm
Average Diameter :  0.27 μm
Total Length :  9947.44 μm
Total Surface :  6503.84 μm2
Total Volume :  659.98 μm3
Max Euclidean Distance :  789.31 μm
Max Path Distance :  890 μm
Max Branch Order :  10
Average Contraction :  0.81
Total Fragmentation :  10568
Partition Asymmetry :  0.43
Average Rall's Ratio :  1.62
Average Bifurcation Angle Local :  86.46°
Average Bifurcation Angle Remote :  62.45°
Fractal Dimension :  1.07

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