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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_172799
Cell Name :  J-3-Left-06-NB_01
Archive Name :  Grilli
Species Name :  mouse
Strain :  C56BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  42.0 days
Max Age :  42.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  21 grams
Max Weight :  28 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  ventral, suprapyramidal blade, left
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  Doublecortin (DCX)-containing, newborn
Original Format :  Simple Neurite Tracer.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  High fat diet
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2021-12-06
Date of Upload :  2022-01-10
Persistence Vector :  J-3-Left-06-NB_01.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Short high fat diet triggers reversible and region specific effects in DCX+ hippocampal immature neurons of adolescent male mice.

Measurements
Soma Surface :  9.66 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  2
Number of Branches :  5
Overall Width :  30.72 μm
Overall Height :  109.66 μm
Overall Depth :  1.6 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  190.69 μm
Total Surface :  149.77 μm2
Total Volume :  9.36 μm3
Max Euclidean Distance :  118.59 μm
Max Path Distance :  134.03 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  520
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  17.78°
Average Bifurcation Angle Remote :  38.32°
Fractal Dimension :  1.03

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