8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_36507
Cell Name :  Image011-009-01
Archive Name :  Seung
Species Name :  mouse
Strain :  GFP-YFP
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.0 month
Max Age :  6.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  retina
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  ganglion
Tertiary Cell Class :  cluster D
Original Format :  Simple Neurite Tracer.swc
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  whole mount
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2014-06-04
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  Image011-009-01.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  A genetic and computational approach to structurally classify neuronal types.

Measurements
Soma Surface :  12.53 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  151
Number of Branches :  305
Overall Width :  153.76 μm
Overall Height :  174.68 μm
Overall Depth :  37.5 μm
Average Diameter :  2 μm
Total Length :  4236.84 μm
Total Surface :  26620.9 μm2
Total Volume :  13310.4 μm3
Max Euclidean Distance :  122.08 μm
Max Path Distance :  167.58 μm
Max Branch Order :  11
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  8436
Partition Asymmetry :  0.62
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  19.54°
Average Bifurcation Angle Remote :  86.41°
Fractal Dimension :  1.05

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