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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_36541
Cell Name :  Image009-016-01
Archive Name :  Seung
Species Name :  mouse
Strain :  GFP-YFP
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.0 month
Max Age :  6.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  retina
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  ganglion
Tertiary Cell Class :  cluster F
Original Format :  Simple Neurite Tracer.swc
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  whole mount
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2014-06-04
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  Image009-016-01.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  A genetic and computational approach to structurally classify neuronal types.

Measurements
Soma Surface :  12.55 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  173
Number of Branches :  348
Overall Width :  139.03 μm
Overall Height :  178.15 μm
Overall Depth :  34.5 μm
Average Diameter :  2 μm
Total Length :  3196.93 μm
Total Surface :  20086.9 μm2
Total Volume :  10043.5 μm3
Max Euclidean Distance :  115.37 μm
Max Path Distance :  184.68 μm
Max Branch Order :  13
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  6304
Partition Asymmetry :  0.64
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  21.3°
Average Bifurcation Angle Remote :  87°
Fractal Dimension :  1.06

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