8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_36365
Cell Name :  Image004-033-01
Archive Name :  Seung
Species Name :  mouse
Strain :  GFP-YFP
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.0 month
Max Age :  6.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  retina
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  ganglion
Tertiary Cell Class :  cluster X
Original Format :  Simple Neurite Tracer.swc
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  whole mount
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2014-06-04
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  Image004-033-01.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  A genetic and computational approach to structurally classify neuronal types.

Measurements
Soma Surface :  12.53 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  68
Number of Branches :  140
Overall Width :  176.86 μm
Overall Height :  221.26 μm
Overall Depth :  28.5 μm
Average Diameter :  2 μm
Total Length :  3693.72 μm
Total Surface :  23208.3 μm2
Total Volume :  11604.2 μm3
Max Euclidean Distance :  137.52 μm
Max Path Distance :  189.99 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.83
Total Fragmentation :  7395
Partition Asymmetry :  0.44
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  56.95°
Average Bifurcation Angle Remote :  68.72°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website