8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_112192
Cell Name :  Huang_JY-bis-KA-3_S1_C01z-ims_1
Archive Name :  Huang_JY
Species Name :  mouse
Strain :  FVB
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  barrel, primary somatosensory, layer 4
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  stellate
Tertiary Cell Class :  Spiny
Original Format :  Imaris.hoc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Kainic acid lesion
Staining Method :  td Tomato fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2019-01-17
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  Huang_JY-bis-KA-3_S1_C01z-ims_1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  FGF-FGFR Mediates the Activity-Dependent Dendritogenesis of Layer IV Neurons during Barrel Formation.

Measurements
Soma Surface :  12.25 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  54
Number of Branches :  112
Overall Width :  104.86 μm
Overall Height :  175.94 μm
Overall Depth :  35.28 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  2172.19 μm
Total Surface :  1706.03 μm2
Total Volume :  106.63 μm3
Max Euclidean Distance :  220.46 μm
Max Path Distance :  250.81 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.96
Total Fragmentation :  2428
Partition Asymmetry :  0.51
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  28.27°
Average Bifurcation Angle Remote :  63.04°
Fractal Dimension :  1.01

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