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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_112184
Cell Name :  Huang_JY-bis-2_S6_C1z-ims_1
Archive Name :  Huang_JY
Species Name :  mouse
Strain :  FVB
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  9.0 days
Max Age :  9.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  barrel, primary somatosensory, layer 4
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  stellate
Tertiary Cell Class :  Spiny
Original Format :  Imaris.hoc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  FGFR1/2/3 Knockout
Staining Method :  td Tomato fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2019-01-17
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  Huang_JY-bis-2_S6_C1z-ims_1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  FGF-FGFR Mediates the Activity-Dependent Dendritogenesis of Layer IV Neurons during Barrel Formation.

Measurements
Soma Surface :  13.07 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  21
Number of Branches :  47
Overall Width :  71.7 μm
Overall Height :  131.28 μm
Overall Depth :  28.49 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  882.95 μm
Total Surface :  693.47 μm2
Total Volume :  43.34 μm3
Max Euclidean Distance :  78.29 μm
Max Path Distance :  91.4 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.96
Total Fragmentation :  919
Partition Asymmetry :  0.54
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  37.56°
Average Bifurcation Angle Remote :  74.11°
Fractal Dimension :  1.01

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