8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_112285
Cell Name :  Huang_JY-bis-2_S2_C3z-ims_1
Archive Name :  Huang_JY
Species Name :  mouse
Strain :  FVB
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  7.0 days
Max Age :  7.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  barrel, primary somatosensory, layer 4
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  stellate
Tertiary Cell Class :  Spiny
Original Format :  Imaris.hoc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  FGF10 Overexpression
Staining Method :  td Tomato fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2019-01-17
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  Huang_JY-bis-2_S2_C3z-ims_1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  FGF-FGFR Mediates the Activity-Dependent Dendritogenesis of Layer IV Neurons during Barrel Formation.

Measurements
Soma Surface :  12.24 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  17
Number of Branches :  37
Overall Width :  63.47 μm
Overall Height :  87.47 μm
Overall Depth :  24.37 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  583.42 μm
Total Surface :  458.22 μm2
Total Volume :  28.64 μm3
Max Euclidean Distance :  65.38 μm
Max Path Distance :  76.52 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  987
Partition Asymmetry :  0.47
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  31.5°
Average Bifurcation Angle Remote :  60.27°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website