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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_78423
Cell Name :  Hilus-03_1
Archive Name :  Papageorgiou_Kann
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  29.0 days
Max Age :  31.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  115 grams
Max Weight :  130 grams
Development :  young adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  hilus
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Pilocarpine-induced epilepsy
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  450  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-06-18
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  Hilus-03_1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Widespread activation of microglial cells in the hippocampus of chronic epileptic rats correlates only partially with neurodegeneration.

Measurements
Soma Surface :  923.09 μm2
Number of Stems :  15
Number of Bifurcations :  24
Number of Branches :  63
Overall Width :  48.77 μm
Overall Height :  32.78 μm
Overall Depth :  7.98 μm
Average Diameter :  1.03 μm
Total Length :  581.6 μm
Total Surface :  1920.57 μm2
Total Volume :  559.09 μm3
Max Euclidean Distance :  35.53 μm
Max Path Distance :  45.43 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  687
Partition Asymmetry :  0.56
Average Rall's Ratio :  1.66
Average Bifurcation Angle Local :  87.93°
Average Bifurcation Angle Remote :  89.59°
Fractal Dimension :  1.07

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