8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_92759
Cell Name :  HS_st218_MT4__576ef4d72e0000daf0834c21__pwerner__33d15c
Archive Name :  Helmstaedter
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Neurites, No Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  25.0 days
Max Age :  25.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  45 grams
Max Weight :  45 grams
Development :  young adult
Primary Brain Region :  entorhinal cortex
Secondary Brain Region :  medial
Tertiary Brain Region :  layer 2, right
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Knossos.nml
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  osmium tetroxide/uranyl acetate
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  500  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Knossos
Date of Deposition :  2017-10-24
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  HS_st218_MT4__576ef4d72e0000daf0834c21__pwerner__33d15c.pvec
Note :  Motortile 4 imaging region

Reference Article
Related Article Reference :  Axonal synapse sorting in medial entorhinal cortex.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  18
Number of Branches :  38
Overall Width :  48.48 μm
Overall Height :  42.55 μm
Overall Depth :  52.79 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  492.96 μm
Total Surface :  387.17 μm2
Total Volume :  24.2 μm3
Max Euclidean Distance :  58.68 μm
Max Path Distance :  107.58 μm
Max Branch Order :  10
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  354
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  101.43°
Average Bifurcation Angle Remote :  77.84°
Fractal Dimension :  1.04

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