8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_92563
Cell Name :  HS_st218_MT4__56b66c701600003f7ac8f040__pwerner__6702b7
Archive Name :  Helmstaedter
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Neurites, No Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  25.0 days
Max Age :  25.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  45 grams
Max Weight :  45 grams
Development :  young adult
Primary Brain Region :  entorhinal cortex
Secondary Brain Region :  medial
Tertiary Brain Region :  layer 2, right
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Knossos.nml
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  osmium tetroxide/uranyl acetate
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  500  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Knossos
Date of Deposition :  2017-10-24
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  HS_st218_MT4__56b66c701600003f7ac8f040__pwerner__6702b7.pvec
Note :  Motortile 4 imaging region

Reference Article
Related Article Reference :  Axonal synapse sorting in medial entorhinal cortex.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  11
Number of Branches :  24
Overall Width :  66.37 μm
Overall Height :  140.08 μm
Overall Depth :  109.31 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  740.72 μm
Total Surface :  581.76 μm2
Total Volume :  36.36 μm3
Max Euclidean Distance :  122.12 μm
Max Path Distance :  190.55 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  719
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  111.28°
Average Bifurcation Angle Remote :  90.85°
Fractal Dimension :  1.03

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