8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_92019
Cell Name :  HS_st218_MT3__56a775c41600003167aa8ad5__pwerner__c18cb7
Archive Name :  Helmstaedter
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Neurites, No Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  25.0 days
Max Age :  25.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  45 grams
Max Weight :  45 grams
Development :  young adult
Primary Brain Region :  entorhinal cortex
Secondary Brain Region :  medial
Tertiary Brain Region :  layer 2, right
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Knossos.nml
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  osmium tetroxide/uranyl acetate
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  500  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Knossos
Date of Deposition :  2017-10-24
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  HS_st218_MT3__56a775c41600003167aa8ad5__pwerner__c18cb7.pvec
Note :  Motortile 3 imaging region

Reference Article
Related Article Reference :  Axonal synapse sorting in medial entorhinal cortex.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  0
Number of Branches :  2
Overall Width :  0.55 μm
Overall Height :  20.65 μm
Overall Depth :  0.9 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  23.13 μm
Total Surface :  18.16 μm2
Total Volume :  1.14 μm3
Max Euclidean Distance :  17.66 μm
Max Path Distance :  18.85 μm
Max Branch Order :  1
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  65
Partition Asymmetry :  0
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  161.98°
Average Bifurcation Angle Remote :  166.68°
Fractal Dimension :  1.02

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