8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_91917
Cell Name :  HS_st218_MT3__56a775c41600001067aa8984__nberghaus__b5bb1a
Archive Name :  Helmstaedter
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Neurites, No Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  25.0 days
Max Age :  25.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  45 grams
Max Weight :  45 grams
Development :  young adult
Primary Brain Region :  entorhinal cortex
Secondary Brain Region :  medial
Tertiary Brain Region :  layer 2, right
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Knossos.nml
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  osmium tetroxide/uranyl acetate
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  500  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Knossos
Date of Deposition :  2017-10-24
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  HS_st218_MT3__56a775c41600001067aa8984__nberghaus__b5bb1a.pvec
Note :  Motortile 3 imaging region

Reference Article
Related Article Reference :  Axonal synapse sorting in medial entorhinal cortex.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  1
Number of Branches :  3
Overall Width :  1.99 μm
Overall Height :  58.22 μm
Overall Depth :  9.92 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  73.94 μm
Total Surface :  58.07 μm2
Total Volume :  3.63 μm3
Max Euclidean Distance :  61.78 μm
Max Path Distance :  68.06 μm
Max Branch Order :  1
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  54
Partition Asymmetry :  0
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  132.31°
Average Bifurcation Angle Remote :  72.38°
Fractal Dimension :  1.01

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