8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_91739
Cell Name :  HS_st218_MT3__564761761400005f4f570dce__jschmidt-engler__087c5f
Archive Name :  Helmstaedter
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Neurites, No Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  25.0 days
Max Age :  25.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  45 grams
Max Weight :  45 grams
Development :  young adult
Primary Brain Region :  entorhinal cortex
Secondary Brain Region :  medial
Tertiary Brain Region :  layer 2, right
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Knossos.nml
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  osmium tetroxide/uranyl acetate
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  500  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Knossos
Date of Deposition :  2017-10-24
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  HS_st218_MT3__564761761400005f4f570dce__jschmidt-engler__087c5f.pvec
Note :  Motortile 3 imaging region

Reference Article
Related Article Reference :  Axonal synapse sorting in medial entorhinal cortex.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  38
Number of Branches :  78
Overall Width :  157.4 μm
Overall Height :  230.27 μm
Overall Depth :  206.71 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  3467.12 μm
Total Surface :  2723.07 μm2
Total Volume :  170.19 μm3
Max Euclidean Distance :  173.23 μm
Max Path Distance :  255.13 μm
Max Branch Order :  12
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  1348
Partition Asymmetry :  0.45
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  88.7°
Average Bifurcation Angle Remote :  73.68°
Fractal Dimension :  1.01

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