8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_91330
Cell Name :  HS_st218_MT2_new__576301c32e0000c8001e79da__hschmidt__1e79e1
Archive Name :  Helmstaedter
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Neurites, No Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  25.0 days
Max Age :  25.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  45 grams
Max Weight :  45 grams
Development :  young adult
Primary Brain Region :  entorhinal cortex
Secondary Brain Region :  medial
Tertiary Brain Region :  layer 2, right
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Knossos.nml
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  osmium tetroxide/uranyl acetate
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  500  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Knossos
Date of Deposition :  2017-10-24
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  HS_st218_MT2_new__576301c32e0000c8001e79da__hschmidt__1e79e1.pvec
Note :  Motortile 2 imaging region

Reference Article
Related Article Reference :  Axonal synapse sorting in medial entorhinal cortex.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  0
Number of Branches :  2
Overall Width :  4.87 μm
Overall Height :  56 μm
Overall Depth :  12.31 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  68.52 μm
Total Surface :  53.82 μm2
Total Volume :  3.36 μm3
Max Euclidean Distance :  44.04 μm
Max Path Distance :  49.73 μm
Max Branch Order :  1
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  38
Partition Asymmetry :  0
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  160.23°
Average Bifurcation Angle Remote :  137.87°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website