8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_91143
Cell Name :  HS_st218_MT1__56cb5799160000fbb3d0e11c__mdell__0fa80f
Archive Name :  Helmstaedter
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Neurites, No Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  25.0 days
Max Age :  25.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  45 grams
Max Weight :  45 grams
Development :  young adult
Primary Brain Region :  entorhinal cortex
Secondary Brain Region :  medial
Tertiary Brain Region :  layer 2, right
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Knossos.nml
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  osmium tetroxide/uranyl acetate
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  500  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Knossos
Date of Deposition :  2017-10-24
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  HS_st218_MT1__56cb5799160000fbb3d0e11c__mdell__0fa80f.pvec
Note :  Motortile 4 imaging region

Reference Article
Related Article Reference :  Axonal synapse sorting in medial entorhinal cortex.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  3
Number of Branches :  7
Overall Width :  4.81 μm
Overall Height :  95.61 μm
Overall Depth :  25.96 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  151.69 μm
Total Surface :  119.14 μm2
Total Volume :  7.45 μm3
Max Euclidean Distance :  88.23 μm
Max Path Distance :  112.7 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.98
Total Fragmentation :  26
Partition Asymmetry :  0.67
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  119.7°
Average Bifurcation Angle Remote :  114.73°
Fractal Dimension :  1.02

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