8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_90619
Cell Name :  HS_st218_MT1__5610e6241500000bdfb23192__pwerner__2723ad
Archive Name :  Helmstaedter
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Neurites, No Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  25.0 days
Max Age :  25.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  45 grams
Max Weight :  45 grams
Development :  young adult
Primary Brain Region :  entorhinal cortex
Secondary Brain Region :  medial
Tertiary Brain Region :  layer 2, right
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Knossos.nml
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  osmium tetroxide/uranyl acetate
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  500  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Knossos
Date of Deposition :  2017-10-24
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  HS_st218_MT1__5610e6241500000bdfb23192__pwerner__2723ad.pvec
Note :  Motortile 4 imaging region

Reference Article
Related Article Reference :  Axonal synapse sorting in medial entorhinal cortex.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  16
Number of Branches :  34
Overall Width :  116.11 μm
Overall Height :  209.79 μm
Overall Depth :  200.5 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  1389.26 μm
Total Surface :  1091.12 μm2
Total Volume :  68.2 μm3
Max Euclidean Distance :  232.19 μm
Max Path Distance :  296.6 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  2301
Partition Asymmetry :  0.51
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  122.24°
Average Bifurcation Angle Remote :  92.15°
Fractal Dimension :  1.03

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