8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_90597
Cell Name :  HS_AG_st122__580f1ee35b00009100e29894__naydin__e2a626
Archive Name :  Helmstaedter
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Neurites, No Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  90.0 days
Max Age :  90.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  235 grams
Max Weight :  235 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  entorhinal cortex
Secondary Brain Region :  medial
Tertiary Brain Region :  layer 2
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Knossos.nml
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  osmium tetroxide/uranyl acetate
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  500  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Knossos
Date of Deposition :  2017-10-24
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  HS_AG_st122__580f1ee35b00009100e29894__naydin__e2a626.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Axonal synapse sorting in medial entorhinal cortex.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  23
Number of Branches :  48
Overall Width :  87.25 μm
Overall Height :  183.07 μm
Overall Depth :  116.9 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  1219.88 μm
Total Surface :  958.09 μm2
Total Volume :  59.88 μm3
Max Euclidean Distance :  189.34 μm
Max Path Distance :  228.78 μm
Max Branch Order :  11
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  1356
Partition Asymmetry :  0.38
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  106.6°
Average Bifurcation Angle Remote :  86.94°
Fractal Dimension :  1.02

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