8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_90582
Cell Name :  HS_AG_st122__580f1ee35b00009100e2983a__kdesch__e2e5eb
Archive Name :  Helmstaedter
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Neurites, No Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  90.0 days
Max Age :  90.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  235 grams
Max Weight :  235 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  entorhinal cortex
Secondary Brain Region :  medial
Tertiary Brain Region :  layer 2
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Knossos.nml
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  osmium tetroxide/uranyl acetate
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  500  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Knossos
Date of Deposition :  2017-10-24
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  HS_AG_st122__580f1ee35b00009100e2983a__kdesch__e2e5eb.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Axonal synapse sorting in medial entorhinal cortex.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  50
Number of Branches :  102
Overall Width :  80.51 μm
Overall Height :  119.93 μm
Overall Depth :  170.96 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  2741.85 μm
Total Surface :  2153.45 μm2
Total Volume :  134.59 μm3
Max Euclidean Distance :  149.94 μm
Max Path Distance :  186.18 μm
Max Branch Order :  14
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  2035
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  87.6°
Average Bifurcation Angle Remote :  69.94°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website