8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_90549
Cell Name :  HS_AG_st122__580f1ee25b0000a700e296ea__naydin__e425ca
Archive Name :  Helmstaedter
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Neurites, No Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  90.0 days
Max Age :  90.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  235 grams
Max Weight :  235 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  entorhinal cortex
Secondary Brain Region :  medial
Tertiary Brain Region :  layer 2
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Knossos.nml
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  osmium tetroxide/uranyl acetate
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  500  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Knossos
Date of Deposition :  2017-10-24
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  HS_AG_st122__580f1ee25b0000a700e296ea__naydin__e425ca.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Axonal synapse sorting in medial entorhinal cortex.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  5
Number of Branches :  12
Overall Width :  54.28 μm
Overall Height :  172.9 μm
Overall Depth :  65.81 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  504.54 μm
Total Surface :  396.26 μm2
Total Volume :  24.77 μm3
Max Euclidean Distance :  130.39 μm
Max Path Distance :  220.71 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  608
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  120.04°
Average Bifurcation Angle Remote :  103.53°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website