8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_90518
Cell Name :  HS_AG_st122__580f1ee25b00009100e2974a__naydin__e3cc11
Archive Name :  Helmstaedter
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Neurites, No Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  90.0 days
Max Age :  90.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  235 grams
Max Weight :  235 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  entorhinal cortex
Secondary Brain Region :  medial
Tertiary Brain Region :  layer 2
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Knossos.nml
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  osmium tetroxide/uranyl acetate
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  500  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Knossos
Date of Deposition :  2017-10-24
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  HS_AG_st122__580f1ee25b00009100e2974a__naydin__e3cc11.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Axonal synapse sorting in medial entorhinal cortex.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  27
Number of Branches :  56
Overall Width :  85.54 μm
Overall Height :  126.65 μm
Overall Depth :  135.88 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  1542.85 μm
Total Surface :  1211.75 μm2
Total Volume :  75.73 μm3
Max Euclidean Distance :  154.8 μm
Max Path Distance :  232.32 μm
Max Branch Order :  16
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  2147
Partition Asymmetry :  0.57
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  107.11°
Average Bifurcation Angle Remote :  92.5°
Fractal Dimension :  1.02

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