8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_10851
Cell Name :  HR26-011d-finito-amap
Archive Name :  Mena-Segovia
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  Not reported
Max Age :  Not reported
Gender :  Male
Min Weight :  250 grams
Max Weight :  310 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  brainstem
Secondary Brain Region :  pedunculopontine nucleus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Non-cholinergic
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Neurobiotin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2013-03-19
Date of Upload :  2014-05-30
Persistence Vector :  HR26-011d-finito-amap.pvec
Note :  Additional reconstruction files of this cell available here.

Reference Article
Related Article Reference :  Cholinergic brainstem neurons modulate cortical gamma activity during slow oscillations.

Measurements
Soma Surface :  549.44 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  13
Number of Branches :  33
Overall Width :  335.21 μm
Overall Height :  763.46 μm
Overall Depth :  44.98 μm
Average Diameter :  0.86 μm
Total Length :  3021.19 μm
Total Surface :  8343.11 μm2
Total Volume :  2099.69 μm3
Max Euclidean Distance :  637 μm
Max Path Distance :  728.45 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  2926
Partition Asymmetry :  0.63
Average Rall's Ratio :  1.74
Average Bifurcation Angle Local :  77.51°
Average Bifurcation Angle Remote :  86.65°
Fractal Dimension :  1.03

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