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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_10857
Cell Name :  HR24-242h-finito
Archive Name :  Mena-Segovia
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  Not reported
Max Age :  Not reported
Gender :  Male
Min Weight :  250 grams
Max Weight :  310 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  brainstem
Secondary Brain Region :  pedunculopontine nucleus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Non-cholinergic
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Neurobiotin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2013-03-19
Date of Upload :  2014-05-30
Persistence Vector :  HR24-242h-finito.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Distinct types of non-cholinergic pedunculopontine neurons are differentially modulated during global brain states.

Measurements
Soma Surface :  587.54 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  12
Number of Branches :  30
Overall Width :  546.39 μm
Overall Height :  1154.08 μm
Overall Depth :  79.52 μm
Average Diameter :  1.11 μm
Total Length :  5710.57 μm
Total Surface :  20270.09 μm2
Total Volume :  6146.2 μm3
Max Euclidean Distance :  860.82 μm
Max Path Distance :  975.84 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.82
Total Fragmentation :  5129
Partition Asymmetry :  0.27
Average Rall's Ratio :  1.44
Average Bifurcation Angle Local :  63.93°
Average Bifurcation Angle Remote :  42.44°
Fractal Dimension :  1.05

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