8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_10876
Cell Name :  HR19-006b-finito-amap
Archive Name :  Mena-Segovia
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  Not reported
Max Age :  Not reported
Gender :  Male
Min Weight :  250 grams
Max Weight :  310 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  brainstem
Secondary Brain Region :  pedunculopontine nucleus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Non-cholinergic
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Neurobiotin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2013-03-19
Date of Upload :  2014-05-30
Persistence Vector :  HR19-006b-finito-amap.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Cholinergic brainstem neurons modulate cortical gamma activity during slow oscillations.

Measurements
Soma Surface :  782.71 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  9
Number of Branches :  23
Overall Width :  176.76 μm
Overall Height :  419.01 μm
Overall Depth :  12.93 μm
Average Diameter :  1.15 μm
Total Length :  1860.12 μm
Total Surface :  7028.19 μm2
Total Volume :  2744.51 μm3
Max Euclidean Distance :  432.93 μm
Max Path Distance :  489.57 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  1760
Partition Asymmetry :  0.44
Average Rall's Ratio :  1.09
Average Bifurcation Angle Local :  63.71°
Average Bifurcation Angle Remote :  65.33°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website