8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_10868
Cell Name :  HR17-002b-finito
Archive Name :  Mena-Segovia
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  Not reported
Max Age :  Not reported
Gender :  Male
Min Weight :  250 grams
Max Weight :  310 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  brainstem
Secondary Brain Region :  pedunculopontine nucleus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  cholinergic
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Neurobiotin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2013-03-19
Date of Upload :  2014-05-30
Persistence Vector :  HR17-002b-finito.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Cholinergic brainstem neurons modulate cortical gamma activity during slow oscillations.

Measurements
Soma Surface :  1675.34 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  12
Number of Branches :  31
Overall Width :  2358.28 μm
Overall Height :  2529 μm
Overall Depth :  83.65 μm
Average Diameter :  0.59 μm
Total Length :  12099.2 μm
Total Surface :  24947.3 μm2
Total Volume :  6572.14 μm3
Max Euclidean Distance :  2207.23 μm
Max Path Distance :  2615.65 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.83
Total Fragmentation :  11144
Partition Asymmetry :  0.33
Average Rall's Ratio :  1.26
Average Bifurcation Angle Local :  76.64°
Average Bifurcation Angle Remote :  66.46°
Fractal Dimension :  1.05

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