8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_10858
Cell Name :  HR04-014a-finito
Archive Name :  Mena-Segovia
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  Not reported
Max Age :  Not reported
Gender :  Male
Min Weight :  250 grams
Max Weight :  310 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  brainstem
Secondary Brain Region :  pedunculopontine nucleus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Non-cholinergic
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Neurobiotin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2013-03-19
Date of Upload :  2014-05-30
Persistence Vector :  HR04-014a-finito.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Distinct types of non-cholinergic pedunculopontine neurons are differentially modulated during global brain states.

Measurements
Soma Surface :  1176.75 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  8
Number of Branches :  20
Overall Width :  374.11 μm
Overall Height :  850.65 μm
Overall Depth :  174.53 μm
Average Diameter :  1.03 μm
Total Length :  3413.97 μm
Total Surface :  11007 μm2
Total Volume :  3220 μm3
Max Euclidean Distance :  590.91 μm
Max Path Distance :  958.86 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.75
Total Fragmentation :  1953
Partition Asymmetry :  0.41
Average Rall's Ratio :  1.81
Average Bifurcation Angle Local :  116.06°
Average Bifurcation Angle Remote :  66.92°
Fractal Dimension :  1.06

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