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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_176909
Cell Name :  HO-1
Archive Name :  Milnerwood
Species Name :  mouse
Strain :  B6.Cg-Vps35tm1.1Mjff/J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  16.5 days
Max Age :  16.5 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  embryonic
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.traces
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  D620N knock-in
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  Not applicable
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2021-10-20
Date of Upload :  2022-01-24
Persistence Vector :  HO-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Endosomal traffic and glutamate synapse activity are increased in VPS35 D620N mutant knock-in mouse neurons, and resistant to LRRK2 kinase inhibition.

Measurements
Soma Surface :  87.35 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  82
Number of Branches :  172
Overall Width :  394.58 μm
Overall Height :  495.94 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  6954.52 μm
Total Surface :  5462.07 μm2
Total Volume :  341.38 μm3
Max Euclidean Distance :  322.97 μm
Max Path Distance :  430.55 μm
Max Branch Order :  11
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  5954
Partition Asymmetry :  0.52
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  51.02°
Average Bifurcation Angle Remote :  42.29°
Fractal Dimension :  1.02

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