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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_35356
Cell Name :  HC-T5B
Archive Name :  Henckens
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  400 grams
Max Weight :  400 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA3
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-02-19
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  HC-T5B.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Stress-induced alterations in large-scale functional networks of the rodent brain.

Measurements
Soma Surface :  4093.67 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  25
Number of Branches :  51
Overall Width :  245.25 μm
Overall Height :  512.81 μm
Overall Depth :  131.98 μm
Average Diameter :  1.17 μm
Total Length :  4018.58 μm
Total Surface :  16412.6 μm2
Total Volume :  7450.99 μm3
Max Euclidean Distance :  600.68 μm
Max Path Distance :  686.61 μm
Max Branch Order :  10
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  1613
Partition Asymmetry :  0.54
Average Rall's Ratio :  1.26
Average Bifurcation Angle Local :  60.08°
Average Bifurcation Angle Remote :  49.09°
Fractal Dimension :  1.02

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