8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_35349
Cell Name :  HC-T1
Archive Name :  Henckens
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  400 grams
Max Weight :  400 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA3
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-02-19
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  HC-T1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Stress-induced alterations in large-scale functional networks of the rodent brain.

Measurements
Soma Surface :  2616.55 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  34
Number of Branches :  69
Overall Width :  246.59 μm
Overall Height :  434.09 μm
Overall Depth :  134.98 μm
Average Diameter :  1.52 μm
Total Length :  4656.77 μm
Total Surface :  24104.7 μm2
Total Volume :  13324.8 μm3
Max Euclidean Distance :  619.91 μm
Max Path Distance :  676.91 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  1384
Partition Asymmetry :  0.56
Average Rall's Ratio :  1.41
Average Bifurcation Angle Local :  57.31°
Average Bifurcation Angle Remote :  40.3°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website