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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_35380
Cell Name :  HC-M5
Archive Name :  Henckens
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  400 grams
Max Weight :  400 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA3
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Chronic stress
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-02-19
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  HC-M5.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Stress-induced alterations in large-scale functional networks of the rodent brain.

Measurements
Soma Surface :  2095.56 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  16
Number of Branches :  33
Overall Width :  210.78 μm
Overall Height :  593.8 μm
Overall Depth :  122.98 μm
Average Diameter :  1.64 μm
Total Length :  4057.56 μm
Total Surface :  22766.1 μm2
Total Volume :  12807.3 μm3
Max Euclidean Distance :  675.77 μm
Max Path Distance :  767.2 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  1003
Partition Asymmetry :  0.51
Average Rall's Ratio :  1.49
Average Bifurcation Angle Local :  66.73°
Average Bifurcation Angle Remote :  35.4°
Fractal Dimension :  1.02

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