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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_35324
Cell Name :  HC-H2
Archive Name :  Henckens
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  400 grams
Max Weight :  400 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA3
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-02-19
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  HC-H2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Stress-induced alterations in large-scale functional networks of the rodent brain.

Measurements
Soma Surface :  2073.85 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  34
Number of Branches :  70
Overall Width :  257.86 μm
Overall Height :  533.27 μm
Overall Depth :  132 μm
Average Diameter :  1.46 μm
Total Length :  4801.74 μm
Total Surface :  24145.7 μm2
Total Volume :  13177.4 μm3
Max Euclidean Distance :  668.93 μm
Max Path Distance :  790.52 μm
Max Branch Order :  14
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  1484
Partition Asymmetry :  0.56
Average Rall's Ratio :  1.41
Average Bifurcation Angle Local :  53.77°
Average Bifurcation Angle Remote :  43.94°
Fractal Dimension :  1.02

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