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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_35322
Cell Name :  HC-H1A
Archive Name :  Henckens
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  400 grams
Max Weight :  400 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA3
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-02-19
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  HC-H1A.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Stress-induced alterations in large-scale functional networks of the rodent brain.

Measurements
Soma Surface :  2725.59 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  26
Number of Branches :  53
Overall Width :  145.37 μm
Overall Height :  505.59 μm
Overall Depth :  146.98 μm
Average Diameter :  1.44 μm
Total Length :  4153.1 μm
Total Surface :  19819.5 μm2
Total Volume :  9754.75 μm3
Max Euclidean Distance :  573.65 μm
Max Path Distance :  673.12 μm
Max Branch Order :  14
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  1236
Partition Asymmetry :  0.68
Average Rall's Ratio :  1.36
Average Bifurcation Angle Local :  55.52°
Average Bifurcation Angle Remote :  40°
Fractal Dimension :  1.02

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