8.6.72 - Released: 2025-02-27 - Content: 273466 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_35306
Cell Name :  HC-F1
Archive Name :  Henckens
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  400 grams
Max Weight :  400 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA3
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-02-19
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  HC-F1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Stress-induced alterations in large-scale functional networks of the rodent brain.

Measurements
Soma Surface :  3027.57 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  45
Number of Branches :  92
Overall Width :  137.08 μm
Overall Height :  530.85 μm
Overall Depth :  270.95 μm
Average Diameter :  1.51 μm
Total Length :  5773.84 μm
Total Surface :  28995.7 μm2
Total Volume :  15962.5 μm3
Max Euclidean Distance :  635.61 μm
Max Path Distance :  686.29 μm
Max Branch Order :  10
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  1368
Partition Asymmetry :  0.57
Average Rall's Ratio :  1.41
Average Bifurcation Angle Local :  54.26°
Average Bifurcation Angle Remote :  40.29°
Fractal Dimension :  1.01

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