8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_35373
Cell Name :  HC-E3
Archive Name :  Henckens
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  400 grams
Max Weight :  400 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA3
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Chronic stress
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-02-19
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  HC-E3.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Stress-induced alterations in large-scale functional networks of the rodent brain.

Measurements
Soma Surface :  2792.47 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  43
Number of Branches :  88
Overall Width :  196.76 μm
Overall Height :  499.88 μm
Overall Depth :  119.99 μm
Average Diameter :  1.31 μm
Total Length :  6248.46 μm
Total Surface :  28113.8 μm2
Total Volume :  13369.9 μm3
Max Euclidean Distance :  564.24 μm
Max Path Distance :  649.74 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  1800
Partition Asymmetry :  0.46
Average Rall's Ratio :  1.54
Average Bifurcation Angle Local :  56.07°
Average Bifurcation Angle Remote :  39.89°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website