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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_35304
Cell Name :  HC-D5
Archive Name :  Henckens
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  400 grams
Max Weight :  400 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA3
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-02-19
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  HC-D5.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Stress-induced alterations in large-scale functional networks of the rodent brain.

Measurements
Soma Surface :  5079.44 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  32
Number of Branches :  65
Overall Width :  200.27 μm
Overall Height :  475.2 μm
Overall Depth :  114 μm
Average Diameter :  1.27 μm
Total Length :  3823.06 μm
Total Surface :  16879.7 μm2
Total Volume :  8670.84 μm3
Max Euclidean Distance :  611.37 μm
Max Path Distance :  677.67 μm
Max Branch Order :  13
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  1189
Partition Asymmetry :  0.57
Average Rall's Ratio :  1.38
Average Bifurcation Angle Local :  70.91°
Average Bifurcation Angle Remote :  46.69°
Fractal Dimension :  1.02

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