8.6.70 - Released: 2025-02-04 - Content: 272535 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_06188
Cell Name :  GranuleCell-Nr7-Septal
Archive Name :  Vuksic
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL6/Thy1-GFP
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  not reported
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.nrx
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2009-12-17
Date of Upload :  2011-03-10
Persistence Vector :  GranuleCell-Nr7-Septal.pvec
Note :  Dorsal hippocampus-septal part

Reference Article
Related Article Reference :  3D-reconstruction and functional properties of GFP-positive and GFP-negative granule cells in the fascia dentata of the Thy1-GFP mouse.

Measurements
Soma Surface :  494.71 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  9
Number of Branches :  20
Overall Width :  180.48 μm
Overall Height :  203.77 μm
Overall Depth :  44.08 μm
Average Diameter :  2.07 μm
Total Length :  1726.4 μm
Total Surface :  11471.5 μm2
Total Volume :  6248.72 μm3
Max Euclidean Distance :  223.15 μm
Max Path Distance :  262.62 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  2975
Partition Asymmetry :  0.4
Average Rall's Ratio :  1.58
Average Bifurcation Angle Local :  60.16°
Average Bifurcation Angle Remote :  40.35°
Fractal Dimension :  1.02

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