8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_06186
Cell Name :  GranuleCell-Nr6-Septal
Archive Name :  Vuksic
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL6/Thy1-GFP
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  not reported
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.nrx
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2009-12-17
Date of Upload :  2011-03-10
Persistence Vector :  GranuleCell-Nr6-Septal.pvec
Note :  Dorsal hippocampus-septal part

Reference Article
Related Article Reference :  3D-reconstruction and functional properties of GFP-positive and GFP-negative granule cells in the fascia dentata of the Thy1-GFP mouse.

Measurements
Soma Surface :  438.78 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  10
Number of Branches :  22
Overall Width :  109.24 μm
Overall Height :  223.13 μm
Overall Depth :  38.24 μm
Average Diameter :  1.89 μm
Total Length :  2048.55 μm
Total Surface :  12489.5 μm2
Total Volume :  6265.71 μm3
Max Euclidean Distance :  225.1 μm
Max Path Distance :  243.02 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  3857
Partition Asymmetry :  0.58
Average Rall's Ratio :  1.58
Average Bifurcation Angle Local :  55.23°
Average Bifurcation Angle Remote :  27.49°
Fractal Dimension :  1.02

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