8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_06174
Cell Name :  GranuleCell-Nr11-Septal
Archive Name :  Vuksic
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL6/Thy1-GFP
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  not reported
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.nrx
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2009-12-17
Date of Upload :  2011-03-10
Persistence Vector :  GranuleCell-Nr11-Septal.pvec
Note :  Dorsal hippocampus-septal part

Reference Article
Related Article Reference :  3D-reconstruction and functional properties of GFP-positive and GFP-negative granule cells in the fascia dentata of the Thy1-GFP mouse.

Measurements
Soma Surface :  510.65 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  9
Number of Branches :  19
Overall Width :  190.81 μm
Overall Height :  203.45 μm
Overall Depth :  44.99 μm
Average Diameter :  1.44 μm
Total Length :  1889.64 μm
Total Surface :  8762.77 μm2
Total Volume :  3480.78 μm3
Max Euclidean Distance :  238.56 μm
Max Path Distance :  267.8 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  3987
Partition Asymmetry :  0.25
Average Rall's Ratio :  1.39
Average Bifurcation Angle Local :  52.58°
Average Bifurcation Angle Remote :  33.08°
Fractal Dimension :  1.03

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