8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_194876
Cell Name :  Figure9KI_LPS
Archive Name :  Nam_Yu
Species Name :  mouse
Strain :  Psen2N141I/+
Structural Domains :  Processes, No Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  56.0 days
Max Age :  56.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  20 grams
Max Weight :  20 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Knock-in + lipopolysaccharide injection
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2022-05-30
Date of Upload :  2022-08-23
Persistence Vector :  Figure9KI_LPS.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Presenilin 2 N141I mutation induces hyperactive immune response through the epigenetic repression of REV-ERBα.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  41
Number of Branches :  84
Overall Width :  17.14 μm
Overall Height :  43.59 μm
Overall Depth :  38.59 μm
Average Diameter :  0.7 μm
Total Length :  538.64 μm
Total Surface :  1171.52 μm2
Total Volume :  239.94 μm3
Max Euclidean Distance :  37.08 μm
Max Path Distance :  47.75 μm
Max Branch Order :  17
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  2586
Partition Asymmetry :  0.61
Average Rall's Ratio :  2.02
Average Bifurcation Angle Local :  52.01°
Average Bifurcation Angle Remote :  63.45°
Fractal Dimension :  1.04

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