8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_194885
Cell Name :  Figure3WT_LPS
Archive Name :  Nam_Yu
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Processes, No Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  56.0 days
Max Age :  56.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  20 grams
Max Weight :  20 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  lipopolysaccharide injection
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2022-05-30
Date of Upload :  2022-08-23
Persistence Vector :  Figure3WT_LPS.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Presenilin 2 N141I mutation induces hyperactive immune response through the epigenetic repression of REV-ERBα.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  67
Number of Branches :  136
Overall Width :  14.45 μm
Overall Height :  63.48 μm
Overall Depth :  41.32 μm
Average Diameter :  0.82 μm
Total Length :  734.14 μm
Total Surface :  1892.32 μm2
Total Volume :  484.16 μm3
Max Euclidean Distance :  37.98 μm
Max Path Distance :  55.18 μm
Max Branch Order :  17
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  3639
Partition Asymmetry :  0.65
Average Rall's Ratio :  1.96
Average Bifurcation Angle Local :  60.3°
Average Bifurcation Angle Remote :  75.62°
Fractal Dimension :  1.04

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