8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_111119
Cell Name :  Fig5F
Archive Name :  Herget
Species Name :  zebrafish
Strain :  Tg(OtpECR6:BrbM; hsp:nls-Cre), Tg(Oxt:BrbM; hsp:nls-Cre)
Structural Domains :  Neurites, No Soma
Physical Integrity :  Neurites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  hypothalamus
Secondary Brain Region :  neurosecretory preoptic area (NPO)
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  oxytocinergic neuron (OXT)
Tertiary Cell Class :  hypophysiotropic
Original Format :  Amira.am
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  whole mount
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Amira
Date of Deposition :  2018-12-21
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  Fig5F.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Single-Cell Reconstruction of Oxytocinergic Neurons Reveals Separate Hypophysiotropic and Encephalotropic Subtypes in Larval Zebrafish.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  5
Number of Branches :  12
Overall Width :  27.96 μm
Overall Height :  234.92 μm
Overall Depth :  73.01 μm
Average Diameter :  2.2 μm
Total Length :  434.69 μm
Total Surface :  2691.96 μm2
Total Volume :  1499.35 μm3
Max Euclidean Distance :  239.26 μm
Max Path Distance :  363.19 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  935
Partition Asymmetry :  0.83
Average Rall's Ratio :  1.98
Average Bifurcation Angle Local :  107.11°
Average Bifurcation Angle Remote :  67.13°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website